张肖甫还了解到，马文英、杨廷用在负荆请罪时，曾对众营兵提要求说：“我们两个是不惜一死来让你们脱罪的，你们应该给我们丧葬费和妻儿的生活费。”因此，大家为他们凑了几百金的安抚费，但张肖甫宽宥他们的罪错之后，马、杨二人不仅没有退还这笔钱，甚至提都不提了。这件事搞得大家十分怨恨。此外，九营亲兵中各营带头作乱的人有数十名，张肖甫也大概知道都是谁。
第二年春季海潮起汛的时候，七营亲兵又要出发去防汛了。张肖甫在他们宣誓时，秘密命令游击将军徐景星在每一营中各逮捕了一名带头作乱的人，并立即处决；然后，又逮捕了马文英、杨廷用这两名首领。张肖甫对他俩说：“你们早就自请处死了，到今天才杀你们，算是让你们多活了这么久。你们两人带头作乱，又假借负荆请罪欺骗各个兵卒的钱财，即使我想赦免你们，你俩又怎么面对众人的愤怒呢？”随后，将他们两个也处决了。