张肖甫还了解到,马文英、杨廷用在负荆请罪时,曾对众营兵提要求说:“我们两个是不惜一死来让你们脱罪的,你们应该给我们丧葬费和妻儿的生活费。”因此,大家为他们凑了几百金的安抚费,但张肖甫宽宥他们的罪错之后,马、杨二人不仅没有退还这笔钱,甚至提都不提了。这件事搞得大家十分怨恨。此外,九营亲兵中各营带头作乱的人有数十名,张肖甫也大概知道都是谁。
第二年春季海潮起汛的时候,七营亲兵又要出发去防汛了。张肖甫在他们宣誓时,秘密命令游击将军徐景星在每一营中各逮捕了一名带头作乱的人,并立即处决;然后,又逮捕了马文英、杨廷用这两名首领。张肖甫对他俩说:“你们早就自请处死了,到今天才杀你们,算是让你们多活了这么久。你们两人带头作乱,又假借负荆请罪欺骗各个兵卒的钱财,即使我想赦免你们,你俩又怎么面对众人的愤怒呢?”随后,将他们两个也处决了。